Lug'at

2-Abz - 2-Aminobenzoil, odatda, 2,4-dinitrofenil (Dnp) yoki 3-nitro-tirozin (NitroTyr) bilan qoʻshilib, florofor/Quencher juftlarini hosil qiladi. qo'zg'alish 320 nm, emissiya 420 nm.

3-Abz (m-aminobenzoy kislotasi) ni -aminokislota sifatida ko‘rish mumkin. M-aminobenzoy kislotasi peptid zanjirlariga kiritilganda, bu qattiq burilishga olib keladi.

4-Abz (p-aminobenzoy kislotasi, PABA) tabiiy ravishda hosil boʻlgan benzoik kislota hosilasi boʻlib, qattiq chiziqli boʻshliq sifatida ham foydalanish mumkin.

Abu, L- -Aminobutiril ((S)-2-Amino-butanoil), -aminobutirik kislota, aminokislota hosilasidir. Tabiiy aminokislotalarga strukturaviy o'xshashligi tufayli u ko'pincha peptidlar va peptid mimetikalarini loyihalash va sintez qilishda qo'llaniladi.

Ac asetilni ifodalaydi. N-terminal atsetilatsiyasi tabiatdagi peptidlar uchun keng tarqalgan barqarorlashtiruvchi modifikatsiyadir.

Acm, Acetamidometil, Hg (II) yoki Ag (I) yordamida olib tashlanishi mumkin. Bu ko'p disulfid bog'lari bilan peptidlarni sintez qilishda sistein uchun keng tarqalgan ishlatiladigan tiolni himoya qiluvchi guruhlardan biridir.

ACTH (adrenokortikotrop gormon) oldingi gipofiz bezidan ajralib chiqadigan gormon bo'lib, buyrak usti bezlari korteksini kortikosteroidlarni ishlab chiqarishni rag'batlantiradi.

Aad (L- -aminoadipik kislota) - proteinogen bo'lmagan aminokislota. Uning tuzilishi glutamik kislotaga (Glu) o'xshaydi, uning yon zanjirida qo'shimcha metilen guruhi mavjud.

(2-Aminetoksi)sirka kislotasi, shuningdek, glitsin etil esteri yoki glitsin etilamid sifatida ham tanilgan, peptid modifikatsiyasi sintezida ajratuvchi yoki bogʻlovchi sifatida ishlatilishi mumkin.

1-(1'-adamantil)-1-metil-etoksikarbonil, peptid sintezida juda kislotaga chidamli aminokislotalarni himoya qiluvchi guruh, 3% TFA/CH2Cl2 bilan himoyalanishi mumkin.

AFC (7-Amino-4-triflorometilkumarin) - lyuminestsent birikma boʻlib, chiqarilgan kumarinni 395-400 nm da qoʻzgʻatadi, emissiyasi 495-505 nm.

Kichikroq turlarning kovalent bo'lmagan yopishishi tufayli yuqori molekulyar og'irlikdagi turlar hosil bo'ladi. Xususan, oqsillarda agregatsiya ikkilamchi tuzilmalarga ega qutbsiz yuzalarda sodir boʻlishi mumkin boʻlgan denaturatsiya shaklidir, masalan, odatda molekula ichidagi oʻzaro taʼsirlarni hosil qiluvchi va oqsilning spiral va varaqlarida koʻmilgan. Molekulalar bir-biri bilan o'zaro ta'sir qiladi, ba'zida erimaydigan polimolekulyar shakllarni hosil qiladi. Aggregatsiya oligomerizatsiyadan farq qiladi, yuqori tartibli polimerlarni hosil qilish uchun to'g'ri katlanmış mahalliy oqsillarning normal o'zaro ta'siri.

AHX, Aminogeksanoil,6-aminogeksanoik kislota, shuningdek qisqartirilgan Aca yoki LC, odatda biotin, floroforlar va peptidlar ketma-ketligi o'rtasida qisqa qutbsiz ajratuvchi sifatida taqdim etiladi.

2-Aminoizobutirik kislota pirimidin almashinuvining yakuniy mahsuloti bo‘lib, siydik bilan ajralib chiqadigan va zamburug‘li kelib chiqadigan ayrim antibiotiklarda mavjud bo‘lgan kam uchraydigan oqsil bo‘lmagan aminokislotadir. Peptid sintezi uchun tabiiy aminokislotalarni almashtirish uchun ham ishlatiladi.

Spirtli ichimliklar - bu alkil guruhi yoki uglevodorod zanjiridagi uglerod atomiga biriktirilgan bir, ikki yoki undan ortiq gidroksil guruhlari (−OH) mavjudligi bilan tavsiflangan organik birikmalar. Peptid spirtlari klinik jihatdan muhim birikmalar bo'lib, ular dori-darmonlarni kashf qilish uchun tuzilma-faollik munosabatlari (SAR) tadqiqotlarida etarli darajada o'rganilmagan. Misol uchun, DAMGO Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol ketma-ketligi bilan C-terminalida alkogol bilan o'zgartirilgan opioid retseptorlari agonisti. U m-opioid retseptorlari uchun yuqori selektivlik va yaqinlikka ega.

Aldegid - bu karbonil guruhi uglerod zanjirining oxiridagi uglerod atomiga biriktirilgan organik birikma. Peptid aldegidlar biokimyo va kimyoviy biologiyada proteazlarni inhibe qilish va kimyoviy o'chirish uchun muhim vositadir.

Aloc - Alliloksikarbonil, aminokislotalarni himoya qiluvchi guruh (shuningdek, Alloc qisqartmasi). Himoya Pd(PPh3)4 bilan olib tashlanishi mumkin.

Altsgeymer kasalligi, -amiloid plitalari va tau chigallari bilan belgilanadi, sinaptik disfunktsiya va tozalash yo'llari bilan bog'liq muammolar natijasida kognitiv buzilishlarga olib keladi.

7-Amino-4-metilkumarin (AMC) proteaz tadqiqotlarida peptid belgilarini belgilash uchun keng tarqalgan floresan zonddir. Uning peptidga konjugasiyasi lyuminestsent signalni o'chiradi va proteaza bo'linishidan keyin chiqarilgan AMC 345/445 nm qo'zg'alish/emissiya maksimali bilan ferment faolligini miqdoriy aniqlashi mumkin. Masalan, tozalangan proteazomaning tripsinga o'xshash faolligini aniqlash uchun afzal qilingan substrat floresan peptid, ketma-ketlik bilan: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

Atriyal natriuretik peptid (ANP), qon hajmi va bosimi ortishiga javoban yurak atriyalari tomonidan ishlab chiqariladigan va chiqariladigan gormon. Vazodilatatsiyani rag'batlantirish, siydik ishlab chiqarishni ko'paytirish (diurez) va buyraklardagi natriyning reabsorbtsiyasini kamaytirish orqali suyuqlik balansi va qon bosimini tartibga solish vazifasini bajaradi. Bu harakatlar yuqori qon bosimi va tanadagi suyuqlikning haddan tashqari yuklanishi ta'sirini bartaraf etishga yordam beradi.

Antigenik peptidlar - bu organizmning immun reaktsiyasini qo'zg'atuvchi oqsillar yoki boshqa biomolekulalardan olingan qisqa aminokislotalar ketma-ketligi. Ushbu peptidlar immunitet tizimi tomonidan tanaga begona yoki begona deb tan olinadi, bu T hujayralari va B hujayralari kabi immun hujayralarining faollashishiga olib keladi. Antigenik peptidlar immunitet reaktsiyalarida, shu jumladan adaptiv antikor ishlab chiqarishda va immun xotirani rivojlantirishda hal qiluvchi rol o'ynaydi. Ular patogenlar yoki g'ayritabiiy hujayralarga qarshi o'ziga xos immunitet reaktsiyalarini qo'zg'atish potentsialiga ega bo'lgani uchun immunologiya va vaktsina ishlab chiqishda keng o'rganiladi.

2, 4 va 8 shoxli assimetrik peptidlarning sinteziga strategik ravishda lizin, arginin yoki glutamik kislotani peptidlar ketma-ketligiga kiritish orqali erishish mumkin.

Asimmetrik dimetilarginin (ADMA, Arg (Me) 2) tabiiy ravishda paydo bo'lgan kimyoviy birikma va azot oksidi sintazasining (NOS) endogen inhibitoridir. Fmoc-Arg(Me)2-OH (assimetrik) assimetrik dimetilargininni o'z ichiga olgan peptidlarni sintez qilish uchun bevosita ishlatilishi mumkin.

5-Aminovalerik kislota peptidlarni oʻzgartirish sintezida ajratuvchi yoki bogʻlovchi sifatida ishlatilishi mumkin.

Benziloksimetil (Bom) histidin o'z ichiga olgan peptidlar uchun Boc-SPPS jarayonida ishlatiladigan kislotaga chidamli imidazolni himoya qiluvchi guruhdir. Benziloksimetil kislota bilan ishlov berishdan keyin yuqori reaktiv formaldegid hosil qiladi. Shuning uchun, Bom Cys, metoksiamin yoki aldegidlar bilan reaksiyaga kirishadigan boshqa birikmalar ishtirokida eng yaxshi parchalanadi.

-aminokislotalar o'zlarining aminokislotalari -karboksil guruhidan uzoqda bo'lgan ikkinchi uglerod atomi bo'lgan -uglerodga biriktirilgan. -aminokislota uchun umumiy tuzilish formulasi quyidagicha ifodalanishi mumkin: R−CH(NH2)−COOH

B tipidagi natriuretik peptid (BNP), asosan yurak mushaklari hujayralarining haddan tashqari cho'zilishiga javoban yurak qorinchalari tomonidan ishlab chiqariladigan gormon. Bu qon bosimi va suyuqlik muvozanatini tartibga solishda, birinchi navbatda, vazodilatatsiyani rag'batlantirish va natriyning buyraklar orqali chiqarilishini oshirish orqali hal qiluvchi rol o'ynaydi.

t-Butiloksikarbonil (Boc) peptid sintezida juda kislotali-labilea-amino himoya qiluvchi guruh bo'lib, TFA/metilenxlorid (1:1), etil asetat yoki dioksandagi HCl, 98% chumoli kislotasi bilan parchalanishi mumkin.

2-(4-Bifenilil)izopropiloksikarbonil (Bpoc) peptid sintezida kislota-labilea-amino himoya qiluvchi guruh bo‘lib, 1% TFA/metilenxlorid bilan parchalanishi mumkin.

2, 4 va 8 shoxli peptidlarga lizin, arginin yoki glutamik kislotani peptidlar ketma-ketligiga strategik kiritish orqali erishish mumkin.

t-Butildimetilsilil (TBS yoki TBDMS) Fmoc-SPPS bilan mos keladigan gidroksilni himoya qiluvchi guruhdir. U kislotaga chidamli va ftorid ionlari tomonidan tanlab ajralishi mumkin.

Benzoil ko'pincha peptidlarning N-uchida kiritilgan asil guruhidir. U asetildan (Ac) kamroq qutbga ega va doimiy modifikatsiya sifatida bo'lishi mumkin.

Benzil (Bzl) alkil qoldig'i va peptid sintezida spirtli ichimliklarni (Ser, Thr, Hyp) blokirovka qilish uchun ishlatiladigan yon zanjirli himoya guruhi. u kuchli kislotalar yoki katalitik gidrogenoliz (masalan, vodorod/Pd) bilan parchalanishi mumkin.

Xoletsistokinin (CCK) - yuqori ichak shilliq qavati tomonidan ishlab chiqarilgan va markaziy asab tizimida joylashgan peptid gormoni. U o't pufagining qisqarishini, oshqozon osti bezi fermentini chiqarishni rag'batlantiradi va turli oshqozon-ichak jarayonlariga ta'sir qiladi.

Kalsitonin geniga bog'liq peptid (CGRP) kalsitonin, amilin va adrenomedullin bilan bog'liq 37-aminokislota peptididir. U ikkita shaklda mavjud - CGRP (CGRP I) va -CGRP (CGRP II), o'xshash biologik faolliklarga ega. CGRP asosan hissiy va markaziy neyronlarda joylashgan bo'lib, yurak-qon tomir funktsiyasi, kaltsiy almashinuvi va fetoplasental qon tomir tonusiga ta'sir qiladi. Uning retseptorlari G-oqsil bilan bog'langan va adenilat siklazasini faollashtiradi, ligandlarning o'ziga xosligi va hujayra savdosi uchun retseptorlarning faolligini o'zgartiruvchi oqsillar (RAMP) bilan o'zaro ta'sir qiladi.

L-sikloheksilalanin (Cha) fenilalaninning qutbsiz aminokislota analogidir, bu erda aromatik halqa siklogeksan halqasi bilan almashtiriladi. Ushbu almashtirish tajribalarda fenilalanin qoldiqlarini Cha bilan almashtirish orqali p-p o'zaro ta'sirlari kabi aromatik aminokislotalarning o'zaro ta'siridagi rolini o'rganish imkonini beradi.

L- -Siklogeksilglisin (Chg) qutbsiz aminokislota boʻlib, sterik tarzda toʻsqinlik qiladi. U muhim farmatsevtika vositachisi bo'lib xizmat qiladi va tabiiy mahsulotlarda ham mavjud.

Xolesterin tabiiy ravishda jigar va tanadagi boshqa hujayralar tomonidan ishlab chiqariladi, lekin u biz iste'mol qiladigan oziq-ovqat, ayniqsa go'sht, parranda go'shti va to'liq yog'li sut mahsulotlari kabi hayvonot mahsulotlaridan ham kelib chiqishi mumkin. Farmakokinetikani yaxshilash uchun xolesterinni peptidlar bilan bog'lash mumkin.

sis-gidroksiprolin, tabiiy trans-gidroksiprolinning stereoizomeri.

Tsitrulin oqsillarda arginin qoldiqlarining translatsiyadan keyingi enzimatik modifikatsiyasi natijasida mavjud.

CMK o'xshash kuchga ega, ammo FMKga qaraganda kamroq kimyoviy barqarorlikka ega RSK2 kinaz inhibitori.

C tipidagi natriuretik peptid (CNP) qon tomir endotelial hujayralari tomonidan ishlab chiqariladigan peptid bo'lib, vazodilatator ta'siri bilan mashhur. U atriyal va miya natriuretik peptidlari (ANP va BNP) bilan tizimli va fiziologik o'xshashlikni ko'rsatadi.

L- -Siklopentilglisil (Cpg) — qutbsiz aminokislota boʻlib, u sterik tarzda toʻsqinlik qiladi.

Peptidlar ketma-ketligida aminokislotalar bilan chiziqli ketma-ketlikka bog'langan va uni erkin karboksi guruhi bilan qoldiradigan noyob qoldiq.

Siyanin 3 odatda 558 nm atrofida yorug'lik manbai tomonidan qo'zg'atiladigan va taxminan 572 nm yorug'lik chiqaradigan qizil-lyuminestsent siyanin bo'yoqidir.

Siyanin 5 siyaninli bo'yoq floroforidir, u odatda 646 nm atrofida yorug'lik manbai tomonidan qo'zg'atiladigan va taxminan 664 nm yorug'lik chiqaradigan yaqin infraqizil flüoresansni chiqaradi.

L- , -Diaminobutirik kislota ,ō-diaminokislota bo'lib, ornitin (Orn) va lizin (Lys) ning qisqaroq analogidir. Tegishli himoya bilan, ō-diaminokislotalar Nō holatida tanlab o'zgartirilishi yoki tarmoqlangan peptidlar yoki dendrimerlarni yaratish uchun kiritilishi mumkin.

3-(Dimetilaminoazo)benzol-4-karboksilik kislota biokimyo va molekulyar biologiyada qoʻllaniladigan aminokislotalar bilan bogʻlangan xromofor boʻlib, flüoresan rezonans energiyasini uzatishda (FRET), masalan, EDANS bilan oʻchiruvchi sifatida ishlatiladi. 454 nm da DABCYL qo'zg'alishi.

Dabsyl,4-dimetilaminobenzensulfonilxlorid, aminokislotalar bilan bog'langan xromofor, masalan, EDANS bilan birgalikda söndürücü sifatida ishlatiladi. 436 nm dabsilning qo'zg'alishi.

4-Dimetilamino-1-naftalin-sulfonil, aminokislotalar bilan bogʻlangan florofor, 342 nm da qoʻzgʻalish, 562 nm da emissiya.

L-, -Diaminopropion kislotasi (Dap yoki Dpr) diaminobutirik kislota (Dab), ornitin (Orn) va lizin (Lys) ning qisqaroq analogi bo'lgan ō-diaminokislotadir. ,ō-diaminokislotalarning modifikatsiyalangan hosilalari Nō holatida tanlab o'zgartirilishi yoki tarmoqlangan peptidlar yoki dendrimerlar hosil qilish uchun kiritilishi mumkin.

1-(4,4-Dimetil-2,6-dioksotsiklogeks-1-iliden)etil (Dde) peptid sintezida qoʻllaniladigan aminokimoyaviy guruhdir. U dimetilformamid (DMF) tarkibidagi 2% gidrazingidrat yordamida tanlab bo'linishi mumkin. Nō-Dde Fmoc qattiq fazali peptid sintezi (SPPS) dan so'ng Dap, Dab, Orn yoki Lys kabi aminokislotalardan Dde ni maxsus olib tashlashga imkon beradi, bu Nō-amino guruhining qatronlar ustidagi modifikatsiyasini osonlashtiradi.

Disulfid bog'lari oqsillardagi sistein qoldiqlarining ikki sulfgidril (-SH) guruhi o'rtasida hosil bo'lgan kovalent bog'lanishdir.

2,4-dimetoksibenzil peptid sintezida teskari orqa miya modifikatsiyasi uchun ishlatiladigan kislotaga chidamli formamidni himoya qiluvchi guruhdir. Ular qattiq fazali peptid sintezi (SPPS) jarayonida aminokislota yoki dipeptid Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH) sifatida qo'shiladi, bu erda Fmoc peptid agregatsiyasini oldini oladi va shu bilan samarali cho'zilishga yordam beradi. Dmb shuningdek siklizatsiya reaktsiyalarini rag'batlantiradi va asparagimid hosil bo'lishini oldini oladi. Hmb lotinlaridan farqli o'laroq, Dmb aktivizatsiya paytida benzoksazepinlarni hosil qilmaydi.

2,4-Dinitrofenil aminokislotalarga konjugatsiyalangan xromofor boʻlib, odatda floresan rezonans energiyasini uzatish (FRET) substratlarida oʻchiruvchi sifatida ishlatiladi.

4,4'-Dimetoksiditil, shuningdek, bis-(4-metoksifenil)metil sifatida ham tanilgan, Fmoc qattiq fazali peptid sintezi (SPPS) bilan mos keladigan kislotaga chidamli karboksamidni himoya qiluvchi guruhdir.

DOPA, 3,4-dihidroksifenilalanin, dopamin, norepinefrin va epinefrin kabi bir qancha muhim neyrotransmitterlarning kashshofidir.

(4,7,10-Trikarboksimetil-1,4,7,10-tetraazatsiklododesil)-sirka kislotasi, DOTA deb qisqartiriladi, odatda peptidlarning N-terminusiga biriktirilgan siklik xelatator hisoblanadi. DOTA 68Ga yoki 90Y kabi radionuklidlar bilan peptidlarni turli biotibbiyot dasturlari, jumladan tasvirlash va maqsadli terapiya uchun yorliqlashni osonlashtiradi.

Difenilmetil (ditil), kislotaga chidamli N-, O- va ​​S-himoya qiluvchi guruh.

Dietilentriaminpentaasetik kislota (DTPA) yadro tibbiyotida tasvirlash uchun qo'llaniladigan (68) Ga, (99 m) Tc va (111) In kabi radionuklidlar uchun foydali xelatlashtiruvchi vositadir.

5-[(2-Aminoetil)amino]naftalin-1-sulfonik kislota (EDANS) odatda lizin kabi diaminokislotalarning Nō bilan bog'langan ftorfordir. U tez-tez FRET substratlarida qo'llaniladi, odatda DABCYL kabi söndürücüler bilan bog'lanadi. EDANS qo'zg'alish to'lqin uzunligi 340 nm va 490 nm da chiqaradi.

Endotelial monositlarni faollashtiruvchi polipeptid.

Etil, alkil guruhi va metilning gomologi (Me), peptidlarda doimiy N- va S-etillanish modifikatsiyalari uchun ishlatiladi.

Epitop xaritalash (antigen epitop xaritasi) - bu antikorlar yoki immunitet tizimi tomonidan tan olinishi mumkin bo'lgan antigenning o'ziga xos joylarini (ya'ni antigen epitoplarini) aniqlash uchun ishlatiladigan usul. Antigen epitoplarini chiziqli epitoplar va konformatsion epitoplar ajratish mumkin. Antigen epitopini xaritalash orqali biz antigenning tuzilishi va funktsiyasi o'rtasidagi bog'liqlikni chuqur tushunishimiz mumkin, bu vaktsinani yaratishda, kasalliklar diagnostikasi, immunoterapiya va boshqa jihatlarda katta ahamiyatga ega.
Ba'zi tez-tez ishlatiladigan antigen epitopini xaritalash usullari quyidagilarni o'z ichiga oladi:
X-nurli kristallografiya: u antigenning uch o'lchovli tuzilishini to'g'ridan-to'g'ri tahlil qilishi mumkin va shu bilan epitopning holatini aniqlaydi.
Yadro magnit rezonansi: epitopni aniqlash uchun antigen tuzilishini tahlil qilish uchun ham foydalanish mumkin.
Peptidlarni skanerlash texnikasi: Antikor bilan bog'langan epitopni aniqlash uchun bir-biriga o'xshash sintetik peptid segmentlaridan foydalanish.
Masalan, vaktsinalarni tadqiq qilish va ishlab chiqishda antigendagi asosiy epitoplarni aniqlashtirish samaraliroq vaktsinalarni ishlab chiqishga va ko'proq maqsadli immun reaktsiyasini keltirib chiqarishga yordam beradi; kasallik diagnostikasida muayyan kasalliklarga tegishli antigen epitoplarini aniqlash aniqroq diagnostika reagentlarini ishlab chiqishi mumkin.

5-FAM (5-Karboksiflüoresein) biomolekulalarni belgilashda keng qoʻllaniladigan, qoʻzgʻatuvchi toʻlqin uzunligi 490 nm va emissiyasi 520 nm boʻlgan ftorofordir.

Floressen{0}}karbonil aminokislotalarga biriktirilgan florofor bo'lib, qo'zg'alish to'lqin uzunligi 490 nm va emissiyasi 520 nm.

Floresin izotiyosiyanat (FITC) aminokislotalar bilan reaksiyaga kirishadigan florofordir. Peptidni N-terminalida FITC bilan belgilashda odatda -alanin yoki Ahx kabi spacer kiritiladi. FITC qo'zg'atuvchi to'lqin uzunligi 490 nm va emissiyasi 520 nm.

9-Ftorenilmetil O- va ​​S-himoya qilish uchun ishlatiladigan asosga bogʻliq boʻlmagan himoya guruhidir.

FMK, ftormetil keton, RSK2 kinazning qaytarilmas inhibitoridir.

9-Fluorenilmetoksikarbonil (Fmoc), FMOC qattiq fazali sintezidagi aminokislotalarni himoya qiluvchi guruhni 20% piperidin/DMF bilan olib tashlash mumkin.

Formil - bu Boc-SPPSda ishlatiladigan indolni himoya qiluvchi guruh. Trp(For) merkaptan ishtirokida HF yoki piperidin kabi asoslar bilan parchalanadi.

Floresan-rezonans energiyasini uzatish (FRET) - bu radiatsiyaviy bo'lmagan energiyani qo'zg'atilgan florofordan (donor) mos qabul qiluvchiga (söndürme) o'tkazish. O'tkazish masofaga, dipol orientatsiyasiga va donor va akseptorning spektral bir-biriga mos kelishiga bog'liq. FRET substratlarida florofor va söndürücü peptid zanjiri orqali bog'langan. Enzimatik parchalanish donor va akseptorni ajratish orqali floresansni oshiradi.

Floresans - yorug'lik yoki boshqa elektromagnit nurlanishni o'zlashtiradigan modda tomonidan chiqariladigan yorug'lik. Bu floroforlar deb ataladigan molekulalar ma'lum bir to'lqin uzunlikdagi fotonlarni o'zlashtirganda, hayajonlanganda va keyin fotonlarni chiqarib, asosiy holatiga qaytganda sodir bo'ladi. Chiqarilgan yorug'lik odatda so'rilgan yorug'likdan ko'ra uzunroq to'lqin uzunligi va kamroq energiyaga ega, natijada xarakterli floresan spektri paydo bo'ladi. Ushbu hodisa mikroskopiya, oqim sitometriyasi va floresan spektroskopiya kabi turli xil ilmiy va tibbiy maqsadlarda keng qo'llaniladi.

Glyukozaga bog'liq insulinotrop peptid sifatida ham tanilgan oshqozon inhibitiv polipeptid (GIP) gormonlarning sekretin oilasiga tegishli. U insulin sekretsiyasini rag'batlantiradi, oshqozon kislotasi sekretsiyasini inhibe qiladi va insulin sekretsiyasini va glyukoza gomeostazini tartibga solishda hal qiluvchi rol o'ynaydi.

L- -Karboksiglutamik kislota (Gla) glutamik kislotaning translatsiyadan keyingi karboksillanishi natijasida hosil bo'ladi, natijada osteokalsin kabi kaltsiy ionlarini bog'lash qobiliyatiga ega bo'lgan oqsillar hosil bo'ladi. Gla o'z ichiga olgan peptidlar Fmoc qattiq fazali peptid sintezi (SPPS) yordamida ideal tarzda sintezlanadi, chunki Gla kuchli kislotalar ishtirokida glutamik kislota hosil qilish uchun dekarboksillanishdan o'tishi mumkin.

Glyukagonga o'xshash peptidlar proglyukagonning C-terminal hududidan olingan peptid gormonlarining glyukagon super oilasining a'zolaridir. Ular asosan ichak L hujayralari tomonidan sintezlanadi.

Gonadotropin chiqaradigan gormon (LHRH) - bu gipotalamus neyrosekretor hujayralarida ishlab chiqariladigan va pulsatsiyalanuvchi portlashlarda gipofiz portali aylanishiga chiqariladigan dekapeptid gormoni. Pulsatsiyalanuvchi sekretsiya reproduktiv funktsiyalar, jinsiy rivojlanish va differentsiatsiya uchun juda muhimdir.

O'sish gormoni chiqaradigan gormon (GHRH), shuningdek, somatorelin sifatida ham tanilgan, gipofiz bezini o'sish gormonini chiqarish va sintez qilish uchun rag'batlantiradigan gipotalamus peptid gormoni.

O'sish gormoni chiqaradigan gormon (GHRH), shuningdek, somatorelin sifatida ham tanilgan, gipofiz bezini o'sish gormonini chiqarish va sintez qilish uchun rag'batlantiradigan gipotalamus peptid gormoni.

Inson leykotsitlar antijeni (HLA) immunitet tizimining begona moddalarni tanib olishida hal qiluvchi rol o'ynaydigan hujayralar yuzasida joylashgan oqsillar guruhiga ishora qiladi. Ular odamlarda asosiy gistokompozitsiya kompleksi (MHC) genlari tomonidan kodlangan va T hujayralariga antigenlarni taqdim etish uchun zarur bo'lib, immunitet tizimiga o'z-o'zidan va o'z-o'zidan bo'lmagan hujayralarni ajratishga imkon beradi. HLA molekulalari juda xilma-xil va polimorf bo'lib, individual immunitet reaktsiyalariga va otoimmün kasalliklarga va transplantatsiyani rad etishga moyilligiga sezilarli hissa qo'shadi.

2-gidroksi-4-metoksibenzil - kislotaga chidamli formamidni himoya qiluvchi guruh bo‘lib, peptid sintezida orqa miyaning qaytariladigan modifikatsiyasi uchun ishlatiladi. U qattiq fazali Fmoc peptid sintezi (SPPS) jarayonida aminokislota yoki Fmoc-Hmb dipeptid (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) sifatida kiritilgan bo'lib, agregatsiyani oldini oladi va peptidlarning samarali kengayishini ta'minlaydi. Hmb shuningdek siklizatsiya reaktsiyalarida yordam beradi va asparagin hosil bo'lishini oldini oladi.

L-homoarginin L-argininning gomologi bo'lib, Xar deb qisqartiriladi va plazma va siydikda topilishi mumkin. Homoarginin lizinning guanidinlanishi natijasidir, u peptidlar va oqsillarda ham amalga oshirilishi mumkin.

Homocitrulline L-sitrulinning gomologi bo'lib, Hci deb qisqartiriladi va inson siydigida aniqlanishi mumkin.

L-homosistein sisteinning gomologi bo'lib, Hcy deb qisqartiriladi va metioninning demetilatsiyasi natijasida hosil bo'ladi. Qondagi Hcy darajasining ko'tarilishi yurak-qon tomir va neyrodegenerativ kasalliklar uchun xavf omilidir. Cys hosilalaridan farqli o'laroq, Hcy hosilalari ulanish paytida rasemizatsiyalanmaydi va - yo'q qilmaydi.

L-leysinning gomologlari, Hle deb qisqartiriladi.

Homofenilalanin, fenilalaninning gomologi, Hph deb qisqartiriladi, ACE va renin inhibitörlerinin tarkibiy qismidir. Fmoc-Homophe-OH potentsial yallig'lanishga qarshi doridir.

L-homoprolin yoki L-pikol kislotasi, Pip yoki Hpr sifatida qisqartiriladi. Prolin gomologi Hpr L-lizinning parchalanish mahsulotidir. Ikkala enantiomer ham inson plazmasida aniqlanishi mumkin. Prolin qoldiqlari peptidning konformatsiyasiga kuchli ta'sir qilganligi sababli, Pro ni Hpr (yoki azetidin{3}}karboksilik kislota (Aze)) bilan almashtirish uning ikkilamchi tuzilishini modulyatsiya qilishi mumkin.

L-transgidroksiprolin prolinning oksidlanishi natijasida translatsiyadan keyin hosil bo'ladi. Hyp kollagen va midiya oqsilining asosiy tarkibiy qismidir.

Izoserin, L-serinning izomeri - aminokislotadir.

ivDde, aminokislotalarni himoya qiluvchi guruh, DMFdagi 2% gidrazingidrat bilan himoyalanishi va parchalanishi mumkin. Fmoc-SPPS davrida tez-tez ko'p piperidin bilan davolash uchun ivDde Dde ga qaraganda barqarorroq. Nō-ivDde ni Dap, Dab Orn yoki Lys dan tanlab olib tashlanishi mumkin, bu Nō-amino guruhining postsintetik qatronlar ustida modifikatsiyasiga imkon beradi.

Keyhole limpet gemosiyanin (KLH) katta kislorod tashuvchi ko'p bo'linmali metalloprotein bo'lib, ulkan kalit teshigi limpet gemosiyanin gemolimfasida joylashgan. Antigen tashuvchisi sifatida KLH odatda maqsadli polipeptidlar ketma-ketligini bog'lash orqali immunogenlikni va antigenni fiksatsiya qilish qobiliyatini oshiradi, bu esa samarali, o'ziga xos va funktsional antikorlarning paydo bo'lishini sezilarli darajada rag'batlantiradi.

Luteinlashtiruvchi gormonni chiqaradigan gormon (LHRH yoki GnRH) - bu gipotalamusdagi neyrosekretor hujayralar tomonidan sintez qilingan va gipofiz portali qon aylanishiga pulsatsiyalangan holda chiqariladigan dekapeptid gormoni. Pulsatsiyalanuvchi sekretsiya reproduktiv funktsiya, jinsiy rivojlanish va differentsiatsiya uchun juda muhimdir.

Peptidlarni loyihalash va sintez qilishda tadqiqotchilar biotin yoki floresan va peptidlar o'rtasida bog'lovchini kiritishlari mumkin. Umumiy hidrofobik ajratuvchi aminogeksanoik kislota (Ahx) va umumiy gidrofilik ajratuvchi poli(etilen) glikol (PEG) hisoblanadi.

Issiqlikka sezgir materiallardan suyuqlikni olib tashlaydigan muzlatish quritish jarayoni. Materiallar muzlatiladi, yuqori vakuum ostida joylashtiriladi va past haroratlarda saqlanadi. Vakuum natijasida hosil bo'lgan bosim muzning suyuq holatdan o'tmasdan qattiq holatdan gazsimon holatga o'tishiga olib keladi. Peptidlar odatda liyofillangan kukun shaklida beriladi.

Suyuqlik xromatografiyasi-mass-spektrometriya murakkab namunalardagi molekulalarning tarkibi va tuzilishi haqida batafsil ma'lumot berish uchun suyuq xromatografiyani massa spektrometriyasi bilan birlashtirgan ko'p qirrali analitik usuldir.

Ko'p antijenik peptidlar. Ko'p antigenik peptid yuqori titrli anti-peptid antikorlar va sintetik peptid vaktsinalarini ishlab chiqarishning kuchli usuli hisoblanadi.

Matritsa yordamida lazerli desorbsiya/ionlanish massa spektrometriyasi (MALDI-MS) ionlarning massa-zaryad nisbatini o‘lchash uchun ishlatiladigan analitik usuldir. Bu, ayniqsa, peptidlar, oqsillar va polimerlar kabi biomolekulalarni tahlil qilish uchun foydalidir.

Mass-spektrometriya (MS) ionlarning massa-zaryad nisbatini (m/z) o‘lchash uchun qo‘llaniladigan kuchli analitik texnikadir.

4-MNA sifatida qisqartirilgan - -metoksi{1}}naftilamid, odatda C terminalida karboksipeptidaza substratiga biriktirilgan ftorfordir. Parchalangan 4M NA 335-350 nm da qo‘zg‘atadi va 410-440 nm da chiqaradi

Metoksibenzensulfonil (Mbs) Boc asosidagi qattiq fazali peptid sintezida (Boc-SPPS) ishlatiladigan guanidilni himoya qiluvchi guruhdir. Ushbu himoya guruhini vodorod ftorid (HF) bilan parchalash orqali himoya qilish mumkin.

4-Metilbenzil (Mbzl) Boc asosidagi qattiq fazali peptid sintezida (Boc-SPPS) ishlatiladigan sulfgidrilni himoya qiluvchi guruhdir. Mbzl tez-tez trifloroasetik kislota (TFA) bilan ishlov berishda metoksibenzilga (Mob) qaraganda barqarorroq va vodorod ftorid (HF) parchalanishi bilan olib tashlanishi mumkin.

(7-Metoksikumarin-4-il)sirka kislotasi (Mca) aminokislotalar bilan bogʻlanishi mumkin boʻlgan florofordir.
Mca floresan rezonans energiyasini uzatish (FRET) substratlari uchun dinitrofenil (Dnp) bilan bog'lanadi. Qo'zg'alish to'lqin uzunligi 325 nm, emissiya to'lqin uzunligi esa 392 nm.

Melaninni kontsentratsiya qiluvchi gormon (MCH) birinchi marta baliq va kalamushlardan ajratilgan tsiklik neyropeptiddir. MCH birinchi navbatda teleost baliqlarida terining pigmentatsiyasini va sutemizuvchilarning ovqatlanish xatti-harakatlarini tartibga solishda ishtirok etadi.

Eng oddiy alkil o'rnini bosuvchi metil peptidning doimiy modifikatsiyasini tashkil etuvchi N-, O- va ​​S-metillanishda ishtirok etadi.

3-Deaminatsiyalangan Asp(OMe) ga mos keladigan metoksisuksinil karboksipeptidaza substratlariga keng tarqalgan qutbli N-terminal blokirovka qiluvchi guruhdir.

Metillanish - bu peptidlar va oqsillarning translatsiyadan keyingi modifikatsiyasi (PTM) bo'lib, unda metil guruhi (-CH3) o'ziga xos aminokislotalar qoldiqlariga, odatda lizin (Lys), arginin (Arg), histidin (His) yoki glutamatga fermentativ ravishda qo'shiladi. Glu). Ushbu modifikatsiya oqsil funktsiyasi, barqarorligi va boshqa molekulalar bilan o'zaro ta'siriga sezilarli ta'sir ko'rsatishi mumkin va shu bilan turli xil hujayra jarayonlarini, shu jumladan genlarni ifodalash, signal uzatish va oqsil-oqsil o'zaro ta'sirini tartibga solishda muhim rol o'ynaydi.

Asosiy gistofulaylik kompleksi (MHC) MHC molekulalarini kodlaydigan genlarni o'z ichiga olgan genetik hududdir. Ushbu molekulalar immunitet tizimida va otoimmunitetda hal qiluvchi rol o'ynaydi. Odamlarda bu kompleks inson leykotsit antijeni (HLA) tizimi sifatida ham tanilgan.

MHC I sinf molekulalari (MHC I) hujayra sirtidagi oqsillar bo'lib, ular hujayra ichidagi peptidlarni sitotoksik T hujayralariga taqdim etadi. Bu immunitet hujayralariga infektsiyalangan yoki g'ayritabiiy hujayralarni tanib olish va yo'q qilishga yordam beradi, bu patogenlar va saratonga qarshi immunitetni himoya qilish uchun juda muhimdir.

MHC II sinf molekulalari (MHC II) hujayra yuzasi oqsillari bo'lib, ular begona moddalardan olingan peptidlarni yordamchi T hujayralariga taqdim etadi. Bu o'zaro ta'sir immunitet reaktsiyalarini muvofiqlashtirish va patogenlarga qarshi boshqa immunitet hujayralarini faollashtirish uchun zarurdir.

Monometillangan arginin (MMA) translatsiyadan keyingi modifikatsiya bo'lib, unda peptid yoki oqsil ichidagi arginin qoldig'ining guanidin azotiga bitta metil guruhi (-CH3) fermentativ ravishda qo'shiladi.

3-merkaptopropilamin, turli biokimyoviy va biomedikal ilovalarda peptid ligand yoki modifikator sifatida ishlatilishi mumkin.

Miristoylanish - bu lipidlarni modifikatsiyalash jarayoni bo'lib, unda uglerodli to'yingan yog' kislotasidan iborat 14-miristoyl guruhi peptidning N-terminali bilan kovalent bog'langan. Ushbu modifikatsiya oqsilni hujayra membranasiga mahkamlash uchun xizmat qiladi, uning joylashishini va turli hujayra jarayonlarida ishtirok etishini osonlashtiradi.

-(1-naftil)-L-alanin fenilalaninga o'xshash qutbsiz aminokislota hosilasidir, lekin fenil guruhi o'rniga naftil guruhiga ega.

-(2-Naftil)alanin - bu fenilalaninga o'xshash qutbsiz aminokislota hosilasi, ammo fenil guruhi o'rniga naftil guruhi mavjud.

3-nitrobenz-2-oksa-1, 3-diazol (NBD) odatda NBD-Cl reagentini peptidga konjugatsiya qilish orqali kiritiladi. NBD etiketli peptidlar membranalar va hujayra biologiyasiga qaratilgan tadqiqotlarda foydaliligi uchun keng tanlanadi.

N-etilamid C-terminal alaninning dekarboksillangan shakli sifatida ko'rib chiqilishi mumkin. LHRH agonisti buserelinda NHEt C-terminal glitsinamidning analogi bo'lib xizmat qiladi. Peptid N-etilamid karboksipeptidazalarning parchalanishiga chidamli.

L-norleucine (Nle) L-metioninning barqaror izosteridir. Agar peptidning biologik faolligi sulfoksid hosil bo'lishi tufayli buzilgan bo'lsa, Nle ni odatda uning funktsional xatti-harakatlarini o'zgartirmasdan Met bilan almashtirish mumkin.

NOTA, 1,4,7-triazasiklononan-1,4,{5}}triasetik kislota, PET tasvirlash vositalarini yaratish uchun asos bo'lib xizmat qiluvchi ikki funksiyali xelatator. Shuningdek, u ko'p valentli effektlar orqali zond dizayni va signalni kuchaytirishda qo'llaniladi va diagnostik galyum radiofarmatsevtikasi sifatida potentsial ilovalarga ega.

N-Me odatda N-metilatsiyaga ishora qiladi, bu kimyoviy modifikatsiyada metil guruhi (-CH 3) molekuladagi azot atomiga biriktiriladi, N-Me-Gly, N-Me-Ser, N-Me kabi. -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me -Val, N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva va boshqalar.

NODAGA,1,4,7-triazatsiklononan,1-glutarik kislota-4,7-diatsetik kislota organometalik radiofarmatsevtikalarni loyihalash va ishlab chiqish uchun ajoyib bifunksional xelatator bo‘lib, muhim xususiyatlarni taklif etadi. diagnostik tasvirlash va maqsadli radioterapiyada qo'llash imkoniyatlari.

2-Nitrofeniltio (Nps) Boc asosidagi qattiq fazali peptid sintezida (Boc-SPPS) ishlatiladigan S-himoya guruhidir. U tiollar tomonidan, xususan, sisteinning erkin sulfgidril guruhi (Cys) orqali parchalanishi mumkin, bu bir vaqtning o'zida disulfid bog'lanishiga olib keladi.

Neyropeptid Y (NPY) miyadagi taniqli neyropeptid va Y neyropeptidi oilasining bir qismi bo'lib, u pankreatik polipeptid (PP) va YY peptidini (PYY) o'z ichiga oladi.

2-Nitro-2-piridilsulfenil (Npys) Boc asosidagi qattiq fazali peptid sintezi (Boc-SPPS) bilan mos keladigan S-himoya qiluvchi guruhdir. Npys tiollar tomonidan, xususan, sisteinning erkin sulfgidril guruhi (Cys) orqali ajralishi mumkin, bu esa bir vaqtning o'zida disulfid bog'lanishiga olib keladi.

Norvalin qutbsiz alifatik aminokislota va -aminobutirik kislotaning gomologi (Abu).

-Naftilamid odatda peptidlarning C-uchida bog'langan karboksipeptidaza substratlarida keng qo'llaniladigan ftorfordir. Parchalangan NA 330 nm da qo'zg'atadi va 370 nm da chiqaradi.

-Naftilamid odatda peptidlarning C-uchida bog'langan karboksipeptidaza substratlarida keng qo'llaniladigan ftorfordir. Parchalangan NA 320-340 nm, emissiyasi 410-420 nm.

Allil ester Fmoc- va Boc-ga asoslangan qattiq fazali peptid sintezi (SPPS) bilan mos keladigan karboksil himoya qiluvchi guruhdir. Alocga o'xshab, allil esterlarni Pd (PPh3) 4 bilan davolash orqali tanlab olib tashlash mumkin. Fmoc-SPPS da Asp(OAll) aspartimidning bazaviy-katalizli hosil bo'lishiga sezgir.

Karboksilni himoya qiluvchi guruh bo'lgan benzil esterni katalitik gidrogenlash (masalan, H2 / Pd) yoki kuchli kislotalar bilan olib tashlash mumkin.

OcHex - bu Boc-ga asoslangan qattiq fazali peptid sintezida (Boc-SPPS) ishlatiladigan standart karboksil himoya guruhi.

4-(N-[1(4,4-Dimetil-2,6-dioksotsiklogeksiliden)-3-etilbutil]amino)benzil efir (ODmab) karboksilni himoya qiluvchi moddadir. Fmoc asosidagi qattiq fazali peptid sintezida (Fmoc-SPPS) ishlatiladigan guruh. DMF tarkibidagi 2% gidrazingidrat yordamida uni parchalash va himoyadan chiqarish mumkin.

2,4-Dimetoksibenzil ester kislotaga chidamliligi yuqori boʻlgan karboksil himoya guruhi boʻlib, uni diklorometandagi 1% TFA yordamida olib tashlash mumkin.

Etil ester, Etil esterlarni olib tashlash uchun zarur bo'lgan qattiq sharoitlar tufayli, etil efirlari bilan peptidlarni o'zgartirish ularning lipofilligi va barqarorligini oshirishi mumkin.

9-Ftorenilmetil ester asosga bogʻliq boʻlmagan karboksilni himoya qiluvchi guruh boʻlib, uni DMFda piperidin yordamida olib tashlash mumkin.

Heksil efirlari, etil efirlarni olib tashlash uchun zarur bo'lgan qattiq sharoitlar tufayli, peptidlarni etil efirlari bilan o'zgartirish ularning lipofilligi va barqarorligini oshirishi mumkin.

L-Otahidroindol{1}}karboksilik kislota (Oik) qutbsiz aminokislotadir. Ushbu prolin bilan bog'liq aminokislotalarning polipeptidlar ketma-ketligiga kiritilishi peptidning konformatsiyasiga kuchli ta'sir qiladi.

Metil efirlari suyuq fazali sintezda yarim doimiy C-terminal himoya guruhlari bo'lib, ular reaktiv peptid azidlarning prekursorlari bo'lgan peptid gidrazidlarga aylanishi mumkin. Azid birikmasi suyuq fazali peptid sintezida fragmentlarni ulashning eng mashhur usuli bo'lib qolmoqda.

3-Metilpent-3-il ester (OMpe) kislotaga chidamli karboksil himoya qiluvchi guruhdir, Fmoc asosidagi qattiq fazali peptid sintezida (Fmoc-SPPS) aspartik kislotaning (Asp) karboksil guruhini himoya qilish uchun tez-tez ishlatiladi. ).Bu ko'proq talabchan tert-butil ester analogi bazaviy katalizlangan asparagimid hosil bo'lishini kamaytirish uchun maxsus ishlab chiqilgan.

Boc- yoki Z-aminokislotalarning orto-nitrofenil efirlari peptid eritmasi sintezida ishlatiladigan oldindan faollashtirilgan hosilalardir.

Ornitin (Orn) karbamid siklida arginindan ishlab chiqariladi va arginin degradatsiyasi mahsuloti sifatida peptidlarda ham kuzatilishi mumkin. Argininning guanidin qismining asillanishi orqali orn hosil bo'lishi peptid sintezida keng tarqalgan yon reaktsiya hisoblanadi.

Gidroksisuksinimid esteri (OSu, NHS sifatida qisqartirilgan) peptid sintezida, ayniqsa peptid modifikatsiyasida keng qo'llaniladigan oldindan faollashtirilgan aminokislota hosilasidir. OSu esterlari xavfsiz, sterik emas, suvli tizimlar bilan mos keladi va ishlov berish oson.

Tert-butil ester, peptid sintezidagi aminokislotalar uchun kislotaga chidamli karboksil himoya qiluvchi guruh.

4-aminobenzoy kislotasi (para-aminobenzoy kislotasi), Antikor-dori konjugat bogʻlovchilarini sintez qilish uchun ishlatilishi mumkin. Masalan, Mal-PEG2-Val-Cit-PABA ajraladigan antikor dori konjugati (ADC) bog‘lovchisidir.

PABC (para-aminobenzil karbamat) - bu bog'lovchi sifatida antikor-dori konjugatlari (ADC) sintezida ishlatiladigan kimyoviy birikma. Bu dori-darmonlarni antikorlarga boshqariladigan tarzda biriktirishni osonlashtiradi, bu saratonni davolashda va boshqa biomedikal ilovalarda maqsadli dori-darmonlarni etkazib berishga imkon beradi. Masalan, Mc-Val-Cit-PABC-PNP - bu antikor-dori konjugatlarida (ADC) ishlatiladigan katepsin-ajraladigan bog'lovchi.

Gipofiz adenilatsiklazani faollashtiruvchi polipeptid (PACAP) sutemizuvchilarning miyasida aniq ifodalangan yuqori darajada saqlanib qolgan neyropeptiddir. U o'zining biologik ta'sirini retseptorlarning o'zaro ta'siri orqali hujayra ichidagi siklik AMP darajasini oshirish orqali amalga oshiradi.

Palmitoil, N-terminus yoki yon tomonda kiritilgan qutbsiz asil guruhi. Palmitoillanish oqsillarning translatsiyadan keyingi modifikatsiyasi sifatida ham kuzatilgan.

Fenilasetamid metil qatroni Boc asosidagi qattiq fazali peptid sintezi (Boc-SPPS) uchun maxsus mo'ljallangan qatronlardir. Ushbu qatronda sintezlangan peptidlar HF bo'linishi yordamida chiqarilishi mumkin.

Antikor-dori konjugatlarida (ADC) bog'lovchi antikorni sitotoksik foydali yuk bilan bog'laydi. Foydali yukni tanlash juda muhim, chunki u maxsus bo'shatish mexanizmlari orqali maqsadli to'qimalarga terapiyani etkazib berishda ADClarning samaradorligi va o'ziga xosligini aniqlaydi.

2,2,4,6,7-Pentamethyldihidrobenzofuran-5-sulfonil (Pbf) Fmoc asosidagi qattiq fazali peptid sintezida (Fmoc-SPPS) ishlatiladigan afzal guanidino himoya qiluvchi guruhdir. U Pmc bilan solishtirganda bir oz yuqori kislotalilik qobiliyatini namoyish etadi.

Penitsilamin L-sisteinning analogi bo'lib, metil guruhini (-CH3) karboksilik kislota (-COOH) bilan almashtirish bilan tavsiflanadi.

Peptidlarning o'z-o'zini yig'ishi - bu peptidlarning tashqi aralashuvisiz tabiiy ravishda tartiblangan tuzilmalarga joylashishi. bu jarayon vodorod bog'lanishi, hidrofobik o'zaro ta'sirlar, elektrostatik kuchlar va p-p stacking kabi kovalent bo'lmagan o'zaro ta'sirlar bilan boshqariladi. Peptidlarni o'z-o'zidan yig'ish materialshunoslik, biotexnologiya va tibbiyotda qo'llaniladigan tolalar, sharlar, choyshablar va jellar kabi turli xil nanostrukturalarning shakllanishiga olib kelishi mumkin.

Fenilatsetil (Phenylac yoki Phac) odatda peptidlarning N-uchida bog'langan asil guruhi bo'lib, asetil (Ac) ga nisbatan pastroq qutblilik bilan tavsiflanadi. Bu peptidlarning doimiy modifikatsiyasini tashkil qiladi.

fenilglisin (Phg) aminokislota hosilasi bo'lib, glitsin molekulasidagi vodorod atomini fenil guruhi almashtiradi.

Peptid Histidin Isoleucine (PHI), VIP va sekretin bilan bog'liq cho'chqa peptidi.

Peptid histidin metionin (PHM), VIP bilan bog'liq inson peptidi.

Izoelektrik nuqta (pI) protein/peptidning nol zaryadiga ega bo'lgan pH darajasi sifatida aniqlanadi (Smoluch va boshq., 2016).

2,2,5,7,8-Pentametilkroman-6-sulfonil (Pmc) Fmoc asosidagi qattiq fazali peptid sintezida (Fmoc-SPPS) keng qo'llaniladigan guanidinilni himoya qiluvchi guruhdir. Pbf bilan solishtirganda kislotaga chidamliligi biroz kamroq ekanligi qayd etilgan.

p-Nitroanilin, xromofor, odatda karboksipeptidaza substratlarining C-terminaliga konjugatsiya qilinadi. Chiqarilgan p-nitroanilinning yutilishi odatda 405 yoki 410 nm atrofida to'lqin uzunliklarida o'lchanadi.

L-propargilglisin (Pra) mikroorganizmlar tomonidan ishlab chiqariladi. Ushbu aminokislota o'zining uch tomonlama bog'langan tuzilishi bilan ajralib turadi, "klik kimyosi" reaktsiyalarida ishtirok eta oladigan peptidlarni sintez qilish uchun asosiy birlik sifatida yuqori baholanadi va bu sohada katta e'tiborni tortadi.

Paratiroid gormoni (PTH) paratiroid bezlari tomonidan chiqariladigan peptid gormoni bo'lib, hujayradan tashqari suyuqlikda kaltsiy va fosfor gomeostazini saqlash uchun juda muhimdir.

Proteinlarning post-translatsion modifikatsiyalari (PTM) funktsional guruhlar yoki oqsillarni qo'shadi, tartibga soluvchi subbirliklarni kesib tashlaydi yoki butun oqsillarni parchalaydi. Fosforlanish, glikozillanish, metillanish, atsetillanish, lipidlanish, ubiquitinatsiya, nitrozillanish va proteoliz kabi bu o'zgarishlar hujayralarning normal va kasallik davrida qanday ishlashiga ta'sir qiladi. PTMlarni tushunish asosiy tadqiqotlar va yangi davolash usullarini topish uchun juda muhimdir.

Pgl, Glp, pGlu yoki kabi qisqartmalar bilan ham tanilgan piroglutamik kislota

fenilazobenzilmetoksikarbonil - peptid sintezida ishlatiladigan, katalitik gidrogenatsiya yoki kuchli kislota bilan parchalanadigan xromoforik N-himoya guruhi. U 229 nm, 320 nm va 441 nm da maksimal yutilish to'lqin uzunliklarini namoyish etadi.

Söndürme juftligi floresan molekula (fluorofor) va floresanga asoslangan tadqiqot va tahlillarda ishlatiladigan söndürücü molekuladan iborat. Söndürgich florofor chiqaradigan yorug'likni o'ziga singdirib, uning floresansini pasaytiradi. Ftorfor va söndürücü ajratilganda, masalan, biokimyoviy reaktsiya orqali, flüoresan signali kuchayadi. Bu tadqiqotchilarga real vaqtda o'zgarishlar va o'zaro ta'sirlarni o'lchash imkonini beradi. Ushbu usul odatda real vaqtda PCR, molekulyar zondlar va FRET (Förster rezonans energiya uzatish) tahlillari kabi ilovalarda qo'llaniladi.

Ftor-18 to'qimalarda glyukoza almashinuvini baholash uchun PET tasvirida keng qo'llaniladigan radioligand bo'lib, saraton tashxisi va miya tasvirida keng qo'llaniladi.

Tasodifiy peptidlar kutubxonasi tasodifiy ravishda yaratilgan ko'plab qisqa peptid ketma-ketliklarining to'plamidir. Kutubxonadagi har bir peptid turli xil peptid molekulalarini yaratadigan tasodifiy aniqlangan ketma-ketliklarga ega bo'lgan ma'lum miqdordagi aminokislotalarga ega. Tadqiqotchilar ushbu kutubxonalardan o'ziga xos xususiyatlarga, biologik faollikka yoki maqsadli molekulalar bilan o'zaro ta'sirga ega bo'lgan peptidlarni tekshirish uchun foydalanadilar. Ular, ayniqsa, dori-darmonlarni kashf qilish, immunologiya va oqsil-oqsil o'zaro ta'sirini o'rganishda foydali bo'lib, yangi terapevtiklarni aniqlash va murakkab biologik jarayonlarni tushunishga yordam beradi.

Qoldiq peptid yoki oqsil tarkibidagi individual aminokislotadir. Aminokislotalar peptid bog'lari orqali bu zanjirlarni hosil qilganda, har bir aminokislota birligi qoldiq deb ataladi. Bu atama, chunki peptid aloqasi hosil bo'lganda, har bir aminokislota suv molekulasini (H2O) yo'qotib, qoldiq deb ataladigan narsani qoldiradi.

Qatronlar qattiq fazali peptid sintezida (SPPS) aminokislotalarning uzluksiz qo'shilishi uchun mustahkam tayanch sifatida ishlatiladigan erimaydigan polimerdir. Qatronlar boncuklar barqaror va inert sirtni ta'minlaydi, unga dastlabki aminokislotalar kovalent tarzda biriktiriladi, bu esa peptid zanjirini qoldiq bo'yicha qurishga imkon beradi.

Rodamin B yorqin pushtidan qizil ranggacha bo'lgan qo'zg'alish to'lqin uzunligi odatda 540-570 nm atrofida va yorug'lik diapazoni 560-580 nm. Odatda peptidning N-terminal amino guruhi orqali peptidlar ketma-ketligiga konjugatsiya qilinadi.

Teskari fazali yuqori samarali suyuqlik xromatografi.

Struktura-faoliyat munosabatlari (SAR) dorilari preparatning kimyoviy tuzilishi va uning biologik faolligi o'rtasidagi bog'liqlikni o'rganish orqali ishlab chiqiladi.

Sarkosin, eng oddiy N-alkillangan aminokislota.

Simmetrik dimetilarginin (SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (simmetrik) simmetrik dimetilargininni o'z ichiga olgan peptidlarni sintez qilish uchun bevosita ishlatilishi mumkin.

Qattiq fazali peptid sintezi (SPPS) peptidlarni kimyoviy sintez qilish usuli bo'lib, peptidlar ketma-ket himoyalangan aminokislotalarni qo'shish orqali qattiq tayanch yoki qatronda bosqichma-bosqich yig'iladi. SPPS ikkita strategiyani o'z ichiga oladi: Fmoc-SPPS va Boc-SPPS, ular N-amino guruhini himoya qiluvchi guruhlarni (Fmoc yoki Boc) va yon zanjirni himoya qilish guruhlarini tanlashda farqlanadi. Tanlangan N-amino himoya guruhining turi yon zanjirni himoya qilish strategiyasini va peptidni qatrondan yakuniy ajratish shartlarini belgilaydi.

Statin, Sta sifatida qisqartirilgan, oqsil bo'lmagan aminokislota bo'lib, ko'pincha peptid mimetikalarini loyihalashda, ayniqsa proteaz inhibitörlerini sintez qilishda ishlatiladi.

Tert-Butylthio (StBu) fosfinni kamaytirish orqali ajraladigan va Boc-SPPS bilan mos keladigan S-himoya qiluvchi guruhdir.

Suksinil - deaminatsiyalangan aspartatga mos keladigan va odatda karboksipeptidaza substratlariga kiritilgan qutbli N-terminal modifikatsiyasi.

TAMRA, shuningdek, TMR sifatida qisqartirilgan, aminokislotalarga biriktirilishi mumkin bo'lgan florofordir. Ko'pincha FRET substratlari uchun FAM bilan birgalikda ishlatiladi. TAMRA qo'zg'alish to'lqin uzunligi 485 nm va emissiya to'lqin uzunligi 535 nm.

Tert-butil trifloroasetik kislota (TFA) yordamida parchalanishi mumkin bo'lgan spirtlar va fenollar uchun keng tarqalgan bo'lib ishlatiladigan kislotaga chidamli himoya guruhidir.

Trietilamonyum fosfat teskari fazali HPLC mobil fazalarida ishlatiladigan buferdir.

Trifloroasetik kislota (TFA) Fmoc-SPPS da qatrondan peptidlarni ajratish va tBu-dan olingan himoya guruhlarini olib tashlash uchun ishlatilgan.

Triflorometansülfonik kislota (TFMSA) TFAga qaraganda kuchliroq kislotadir. TFMSA Boc-SPPS strategiyasining yakuniy bo'linish bosqichi uchun yuqori zaharli HF ga xavfsizroq alternativ sifatida ishlatilishi mumkin.

L-tert-leysin (Tle) - spirallarni beqarorlashtiradigan sterik talabchan yon zanjirlarga ega bo'lgan qutbsiz aminokislotadir.

2,4,6-Trimetoksibenzil Fmoc-SPPS da qoʻllaniladigan kislotaga chidamli Asn va Gln amid himoya guruhidir.

Tosil Boc-SPPSda guanidin va imidazolni himoya qiluvchi guruh sifatida ishlatiladi va Na/NH3 bilan olib tashlanishi mumkin.

Tritil (Trt) Fmoc-SPPSdagi Asn, Cys, Gln va Uning qoldiqlari uchun ishlatiladigan kislotaga chidamli himoya guruhidir. U trifloroasetik kislota (TFA) yordamida tanlab olib tashlanishi mumkin.

Sof peptidlar odatda muzlatish bilan quritilganidan keyin oq chang holatida mavjud.

Vazoaktiv ichak peptidi (VIP) glyukagon-grelin-sekretin peptidlar oilasiga mansub 28-aminokislotalar peptididir.

9-Ksangidril (Ksan) Boc-SPPSdagi Asn va Gln qoldiqlari uchun ishlatiladigan kislotaga chidamli amid himoya guruhidir. Xan TFA yordamida tanlab olib tashlanishi mumkin.

Peptid FAM floresein bilan belgilangan bo'lsa, liyofillangan kukun odatda sariq ko'rinishga ega bo'ladi.

Z yoki Cbz deb qisqartirilgan Z-benziloksikarbonil peptid sintezida amino himoya qiluvchi guruh sifatida ishlatiladi. Uni gidrogenoliz yoki toza HF yoki HBr / sirka kislotasi kabi kuchli kislotalar yordamida olib tashlash mumkin.